Tag Archives: Mapping population

Q&A in AGH635 Course : If I can not Use Them for Linkage Analysis, what Are They For ?

One of my student raised the following matter: “I have analyzed 200 individuals collected from different places. I evaluated the accessions for resistance against plant disease and also for approximately 100 loci of molecular markers (m1-m100). Results of the analysis … Continue reading

Posted in Kuliah (Courses), Q & A | Tagged , , , | 1 Comment

Q&A in AGH635 Course: Mapping Population Part 4 – Pseudo-Test Cross (Populasi F1 yang Diasumsikan sebagai Populasi BC1)

Pada tanaman setahun, pertumbuhan tanaman dari sejak perkecambahan, periode siklus pertumbuhan vegetatif, hingga siklus generatifnya relatif pendek (misalnya antara 4-6 bulan). Pembuatan berbagai macam tipe mapping population relatif mudah untuk dilakukan. Tetua P1 dan P2 yang homosigot dapat dihasilkan dalam … Continue reading

Posted in Kuliah (Courses), Q & A | Tagged , , , , , | 1 Comment

Q&A in AGH635 Course: Apakah Tanaman yang Diperbanyak Secara Vegetatif, Baik Tetua P1 atau P2 dan Silangan F1-nya, Dapat Digunakan Untuk Membuat Mapping Population untuk Studi Marker Molekuler?

Seorang alumnus yang sebelumnya pernah berasosiasi dengan PMB Lab. dalam program MSc. (S2)-nya di IPB menanyakan sebuah pertanyaan berikut: “Apakah Tanaman yang Diperbanyak Secara Vegetatif, Baik Tetua P1 atau P2 dan Silangan F1-nya, Dapat Digunakan Untuk Membuat Mapping Population untuk … Continue reading

Posted in Kuliah (Courses), Q & A | Tagged , , , , | 1 Comment

Q&A in AGH635 Course: Mapping Population Part 3 – F2 Backcross dan Populasi yang Terkait

Dalam posting sebelumnya telah dibahas tentang pemtingnya membuat Mapping Population [lihat Q&A in AGH635 Course: Mapping Population Versus Association Map (Linkage) Analysis] dan contoh bentuk Mapping Population yang berupa F2 Intercross (lihat: Q&A in AGH635 Course: Mapping Population Part 2 … Continue reading

Posted in Kuliah (Courses), Q & A | Tagged , , , , , | 1 Comment

Q&A in AGH635 Course: Mapping Population Part 2 – F2 Intercross

Setelah memahami mengapa perlu membuat Mapping Population sebagaimana yang dijelaskan dalam posting sebelumnya [lihat Q&A in AGH635 Course: Mapping Population Versus Association Map (Association Linkage) Analysis], pertanyaan berikutnya adalah bagaimana dan apa saja macam Mapping Population yang dapat digunakan? Dalam … Continue reading

Posted in Kuliah (Courses), Q & A | Tagged , , , , , | 4 Comments

Q&A in AGH635 Course: Mapping Population Versus Association Map (Linkage) Analysis

Ketika membaca disertasi dan thesis mahasiswa pascasarjana, kita seringkali menjumpai topik-topik penelitian yang memakai analisis marker molekuler dalam penelitian disertasinya. Berkaitan dengan hal tersebut, ada baiknya kita bersama-sama mencoba memahami beberapa ilustrasi di bawah ini: CASE A: ada 1000 individu … Continue reading

Posted in Kuliah (Courses), Q & A | Tagged , , , , | 3 Comments